Science – ページ 3 – Observation Island

RでPubMedの検索結果を機械学習

Posted on 2018年8月26日 by Oshima / 2件のコメント

はじめに本稿はRのパッケージでdeep learningができると聞いて、ネットで調べながら、パッケージを使う道筋をつけるまでの、忘備録です。サンプルにしたのは、「A薬」で検索した結果と「B薬」で検索した結果を、テキス...

Posted on 2018年8月18日 by Oshima / 0件のコメント

機械学習的な何かはじめにその昔、2001年~2007年にかけて、遺伝子発現解析をやっていた頃、SVM (support vector machine)やNeural Networkを使用していました。肝臓由来の細胞に...

Posted on 2018年6月16日 by Oshima / 0件のコメント

インパクトの大きな医学研究で使用した統計ソフトのコードを公開するべきだという論評 Assel M, Vickers AJ. Statistical Code for Clinical Research Papers in...

Posted on 2018年3月3日 by Oshima / 0件のコメント

RのLearnBayes パッケージで臨床試験と市販後の副作用データを解析してみましたここに提示されるデータは、治験・市販後の実データを元にしていますが、実際のデータではありません。LearnBayesというRのパッケ...

Posted on 2018年3月1日 by Oshima / 0件のコメント

高圧電線と小児白血病 1988年に公開されたSavitzらの論文（症例対象研究）1のデータを触っています。 Caseは白血病症例、Controlはそれ以外の住民。そして、Exposureは閾値を3milligauss (...

Posted on 2018年1月18日 by Oshima / 0件のコメント

海外の医学系ニュースサイトで、先週公開された私の論文が紹介されました。 <https://www.medwirenews.com/oncology/non-small-cell-lung-cancer/risks-...

Posted on 2018年1月12日 by Oshima / 4件のコメント

JAMA oncology誌に昨年投稿した論文が掲載されました。

Posted on 2017年12月28日 by Oshima / 0件のコメント

Case Crossover Design – (3) 前回の記事のつづきです Logistic regression model このアプローチでは、観察期間を単位期間ごと（この場合は1hr）に分割して、イベントが発生...

Posted on 2017年12月27日 by Oshima / 0件のコメント

先日の記事でBCPNNは、WHOが使用しているシグナル検出方法だ、というようなことを書きましたが実はWHOは少し軸足を別のものに移してきています。その名前はvigiRank。1,2 vigiRankとはどういうものでしょ...

Posted on 2017年12月10日 by Oshima / 0件のコメント

Formatting for the Lancet 物は試しというレベルですが、リサーチの結果をthe Lancetに投稿しようとして原稿をフォーマットし直しています。（この作業、たとえば初回のスクリーニング時点では自由...