腸管内に生息する共生細菌叢（マイクロバイオータ）は、その菌体成分や代謝産物を介して腸内環境（マイクロバイオーム）を形成することにより、生体の生理機能や病態生理に多大な影響を及ぼしていることが明らかになりつつある。大腸マイクロバイオーム研究に比較して、小腸マイクロバイオーム研究の知見は十分とは言い難い状況ではあるが、本邦では小腸内視鏡検査が盛んに行われており、臨床的にも小腸マイクロバイオーム研究を世界的にリードする環境にある。本セッションでは小腸マイクロバイオータ・マイクロバイオームが彩る様々な病態生理について基礎的のみならず、臨床的アプローチからの演題も期待しており、活発な議論を進めていきたい。