β-d-グルカンと言えば、感染リスクの高いあるいは状態の悪い患者さんにする検査のイメージがありますが、この食品では健康食品のようなイメージで、βグルカンと書いています。微妙です。時々、カビが生えているような感じがしないのに検査値だけ上がるような方がおられました。こういった食品が影響しているのでしょうかね?
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β-d-グルカンと言えば、感染リスクの高いあるいは状態の悪い患者さんにする検査のイメージがありますが、この食品では健康食品のようなイメージで、βグルカンと書いています。微妙です。時々、カビが生えているような感じがしないのに検査値だけ上がるような方がおられました。こういった食品が影響しているのでしょうかね?
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1992年ころ、東京大学医科学研究所の白金通り[通称プラチナ通り]側の一角にピカッピカのプレハブの建物が建ちました。鳴り物入りで始まったヒトゲノム計画を担うヒトゲノム解析センターです。それまでは、医科学研究所では遺伝子解析にVMS社のVAXコンピュータで使用するGCGというソフトウェアが提供されていました。ヒトゲノム解析センターが稼働し始め、九州大学RIFISから鈴木さんという方がいらっしゃって、コンピュータの環境が変わってきました。ワークステーションがVMS VAXからSUN MicrosystemsのSun Sparc Stationに置き換わり、SUNの上でGCGが実行されるようになりました。そのプレハブの2階にはSUN以外にもいくつかのシステムが導入され、その中にSilicon Graphics社のIRISコンピュータというものがありました。そのIRIS上でQuantaというソフトウェアでは分子モデルを画面上に表示して、目で見ていろいろなことを考えることができました。それから二十数年コンピュータの進化は著しく、当時高額なワークステーションでしか実施できなかったような、分子モデルやドッキングが普通のパソコンでも実用的な時間内にできるようにっています。ということで、分子モデルの表示のプロセスの一部を忘備録として記載です。
EGFR-TKI と Nivolumabの分子の立体構造を掲載しました。
EGFR-チロシンリン酸化酵素阻害薬の一つであるgefitinibと内皮成長因子受容体(EGFR)のキナーゼドメインの立体構造を、公開データベースであるPDBより入手し(PDB# 3UG2)、 その構造を表示しました。
免疫チェックポイント阻害薬であるPD-1阻害薬の一つであるnivolumabのheavy chain およびlight chainのFabドメインと、その標的分子であるprogrammed cell death protein-1 (PD-1) の立体構造を、PDBより入手し(PDB# 5WT9)、その構造を表示しました。
povrayのgalaxy.incファイルを探してみたけど、以前ダウンロードしたサイトが閉鎖されていてなぜかダウンロードできない。ということで、自分のハードディスクを検索。最新版ではないかもしれないけど、ファイルが見つかりました。今度は、なくさないようにgoogle driveに保管しました。(元々誰でもダウンロードできるようなサイトに掲載されていたけど、コピーライトはオリジナルの製作者が保持していて、再配布していいかよくわからないので、私のgoogle driveは非公開です。)
wordpressでHome Pageを作るにあたって、相当苦労したから、その苦労の一部を…
MySQL 5.7 root権限なしにインストール、というのが苦労でした。root権限を使ってのインストールガイドばかりで、root権限なしのインストールの情報になかなか行き着かず、苦労でした。それじゃ、自分はというと具体的になにしたかを記録してなくてorz..で、自分でコンパイルしなさい、とサーバーの説明書には書いてあったけど、出来合いのGeneric Linux 64bit用をアップロードしたものが使用できました。覚えている方針は、ファイルの保管場所を、自分のユーザーディレクトリの下にまとめるように、これにつきます(たぶん)。Web各所の説明には、root 権限有の場合mysqlとかいうlinux上のユーザーを登場させるようになっていますが、mysqlとかいうlinuxユーザーなしに設定しました。(その権限がないんですから)
mysqld daemonが立ち上がった後に、最後にはまったのが、これ
→ Error Establishing a Database Connection in WordPress
define(‘DB_HOST’, ‘localhost‘); → define(‘DB_HOST’, ‘127.0.0.1:8889‘);
sshで接続する際には’wpuser’@’localhost’でもmysqlが立ち上がるのに、wp-config.phpでは’localhost’でなく、’127.0.0.1:port#’で接続できました。ヤレヤレ、ということで、このページが世に送信されることになったのでした。