• 第１回（2006年度）：古田賞　中西照幸（日本大学生物資源科学部）、古田奨励賞　木村鮎子（東京大学大学院理学系研究科）
  • 第２回（2007年度）：古田賞　笠原正典（北海道大学大学院医学研究科）、古田奨励賞　松田泰幸（九州大学大学院理学府）
  • 第３回（2008年度）：古田賞　川畑俊一郎（九州大学大学院理学研究院）、古田奨励賞　矢野　環（東北大学大学院薬学研究科）
  • 第４回（2009年度）：古田賞　倉田 祥一朗（東北大学大学院 薬学研究科）、古田奨励賞　古川 亮平（慶應義塾大学 自然科学研究教育センター）
  • 第５回（2010年度）：古田賞　鈴木譲（東京大学農学部）・末武弘章（福井県立大学海洋生物資源学部）、古田奨励賞　後藤彰（東北大学大学院薬学研究科）・植田祐生（九州大学システム生命科学）
  • 第6回（2011年度）：古田賞　Lee Bok-Luel [李 福律]（National Research Laboratory of Defense Proteins, College of Pharmacy, Pusan National University)、古田奨励賞　坂内 英美（東京大学大学院・理学系研究科・生物科学専攻）
  • 第7回（2013年度）：古田賞 野中　勝（東京大学大学院理学研究科）、古田奨励賞 柴田　俊生（九州大学大学院システム生命科学府
  • 第8回（2014年度）：古田賞 受賞者なし、古田奨励賞：籾内義希（東北大大学院薬学研究科）
  • 第9回（2015年度）：古田賞 中尾実樹 (九州大学大学院農学研究院)、古田奨励賞：小林雄毅（九州大学大学院）、古田トラベルアワード 稲田真理 (水産総合研究センター)
  • 第10回（2016年度）：古田賞 受賞者なし、古田優秀論文賞：古川亮平（岩手医科大学・いわて東北メディカルメガバンク機構）、古田奨励賞：長井広樹（東北大学大学院薬学研究科）
  • 第11回（2017年度）：古田賞 受賞者なし、古田優秀論文賞：槇　光輝（九州大学大学院システム生命科学府）、見目裕之（東北大学大学院薬学研究科）、古田奨励賞：松浦雄太（国立研究開発法人水産研究・教育機構増養殖研究所魚病研究センター）
  • 第12回（2018年度）：古田賞 受賞者なし、古田優秀論文賞：小高智之（福井県立大学海洋生物資源学部）、古田奨励賞：瀧澤文雄（福井県立大学海洋生物資源学部）
  • 第13回（2019年度）：古田賞 森友　忠昭（日本大学・生物資源科学部・獣医学科）、古田優秀論文賞：柴田　俊生（九州大学大学院・理学研究院）、古田奨励賞：熊　莉玖（北里大学・海洋生命科学）