Last Updated: 2023/12/01
連絡先
東京大学 大学院医学系研究科 遺伝情報学
〒113-0033 東京都文京区本郷7-3-1 医学部・研究教育棟N607
Professor, Department of Genome Informatics, Graduate School of Medicine, the University of Tokyo
7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan
E-mail: yuki-okada (at) m.u-tokyo.ac.jp
大阪大学 大学院医学系研究科 遺伝統計学
〒565-0871 大阪府吹田市山田丘2-2 バイオメディカル教育研究棟9F
Professor, Department of Statistical Genetics, Osaka University Graduate School of Medicine
2-2 Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871, Japan
E-mail: yokada (at) sg.med.osaka-u.ac.jp
理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム
〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Team leader, Laboratory for Systems Genetics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan
E-mail: yokada (at) riken.jp
学歴
[1999年3月] 筑波大学附属駒場高等学校卒業
[2005年3月] 東京大学医学部医学科卒業
[2011年3月] 東京大学大学院医学系研究科内科学専攻 博士課程修了,博士(医学)取得
職歴
[2005年4月〜2007年3月] 東京大学医学部附属病院 初期研修プログラム
[2010年4月〜2012年3月] 日本学術振興会 特別研究員
[2012年1月〜2013年11月] Research Fellow, Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School & Broad Institute
[2012年4月〜2013年11月] 日本学術振興会 海外特別研究員
[2013年11月〜2016年3月] 東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 テニュアトラック講師
[2016年4月〜] 大阪大学 大学院医学系研究科 遺伝統計学 教授
[2017年4月〜] 大阪大学 免疫学フロンティア研究センター(IFReC) 免役統計学 教授
[2021年4月〜] 大阪大学 大学院医学系研究科長補佐
[2021年10月〜] 理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム チームリーダー
[2022年4月〜] 東京大学 大学院医学系研究科 遺伝情報学 教授
専門分野
遺伝統計学 バイオインフォマティクス ゲノム免疫学
研究テーマ
遺伝情報と形質情報の結びつきを統計学の観点より評価する、遺伝統計学を専門としています。
ヒトの遺伝情報の解析や新たな遺伝統計解析手法の開発を通じて、疾患の原因の解明、ゲノム創薬、個別化医療の確立を目指しています。
・ シングルセルシークエンス解析
・ 微生物叢メタゲノムショットガンシークエンス解析
・ 大規模ヒトオミクス情報に対する機械学習・深層学習の適用
・ Polygenic Risk Score(PRS)を用いたゲノム個別化医療の実装
・ 日本人集団における自然選択圧と適応進化の解明
・ HLA/KIR imputation法による疾患発症予測バイオマーカー同定
・ Drug-Gene databaseを用いた新規創薬ターゲットの探索
・ 国際バイオバンク連携による大規模ゲノムワイド関連解析(GWAS)の実施
・ 遺伝統計解析手法の開発
受賞歴
2012年 東京大学 総長賞
2012年 日本人類遺伝学会 奨励賞
2012年 第49回 ベルツ賞(2等)
2013年 ASHG/Charles J. Epstein Trainee Award for Excellence in Human Genetics Research - Finalist
2014年 日本リウマチ学会 奨励賞
2014年 公益財団法人痛風財団 田辺三菱賞
2015年 財団法人日本リウマチ財団 三浦記念リウマチ学術研究賞
2015年 文部科学大臣表彰 若手科学者賞
2016年 読売テクノ・フォーラム ゴールド・メダル賞
2016年 日本医師会医学研究奨励賞
2018年 井上リサーチアウォード賞
2020年 日本学術振興会賞
2020年 日本医療研究開発機構(AMED)理事長賞
2020年 大阪大学栄誉教授(称号付与)
2022年 大阪科学賞
2022年 日本人類遺伝学会賞
2023年 日本リウマチ学会賞
2023年 石館・上野賞
所属学会
アメリカ人類遺伝学会 日本人類遺伝学会 日本バイオインフォマティクス学会
日本リウマチ学会 日本免疫学会 日本骨代謝学会 日本癌学会
Softwares and Data sources
講義演習資料
ポスター発表資料
解析プロトコル集
GWAS dataに対するWhole Genome Imputation実施手順[1][2]
Armitage's trend検定・相関係数 r ・拡張Mantel-Haenszel検定に関する考察[1][2]
Monte Carlo Permutationを用いたMulti-Allele Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE)検定に関する考察[1][2]
業績
著作
- 岡田 随象 実験医学増刊 ポストGWAS時代の遺伝統計学 羊土社 ISBN-13:978-4758104104. Web link
- 岡田 随象 ゼロから実践する遺伝統計学セミナー 羊土社 ISBN-13:978-4758120920. Web link
外部資金獲得歴
リンク