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ワンヘルスサイエンティスト Vol 2, 4; April 5, 2021


コウモリから出現するコロナウイルス

渡辺 俊平

岡山理科大学獣医学部 微生物学



  2020年12月現在、世界は依然として新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の制御に困難を抱えている。原因ウイルスは、2002年に中国で流行したSARS coronavirus (SARS-CoV)の近縁種であり、SARS coronavirus 2型(SARS-CoV-2)と命名されている。

  当初の発生報告において、SARS-CoV-2ゲノムは、雲南省のキクガシラコウモリから検出されたコロナウイルス(RaTG13)に最も近縁であることが示された(96%の相同性)(1)。しかし表面糖蛋白質のスパイク(S)遺伝子の受容体結合ドメイン(RBD)のみで比較すると85%の相同性に留まる。一方でセンザンコウからもSARS-CoV-2に関連するウイルスが発見されており、RBD領域のみの短い配列で比較するとSARS-CoV-2に最も近縁となる。

  SARS-CoV出現の起源については、コウモリが保有する複数種のウイルスゲノム間(SARS-CoV近縁ウイルスのゲノム間)において相同組換えが複数回生じたことが原因であると考えられている。そのためSARS-CoV-2の起源についても、近縁ウイルスゲノム間における相同組換えイベントが出現経緯として想定されるものの、正確な経緯は未だ判明していない。

  現在までほとんど注目されていないが、2017年に中国の広東省でブタに重症の下痢症を引き起こす新規感染症、SADS-CoV (swine acute diarrhoea syndrome coronavirus)が発生している (2)。 同年の5月までに24,693頭の子豚が死亡しており(幼豚の致死率は90%)、原因ウイルスは、bat CoV HKU2に最も近縁であった。広東省のコウモリで疫学調査が実施された結果、SADS関連bat CoV (SADSr-CoVs)がキクガシラコウモリより発見されている。そのためコウモリCoVs間での組換えを介してSADS-CoVも出現したと考えられる。

  SARS-CoV-1および-2は、βコロナウイルス属に分類される一方、SADS-CoVはαコロナウイルス属に分類される。このことはαコロナウイルス属に分類されるbat CoVsもコウモリから他の哺乳動物へと種の壁を越えて飛び出し得ることを示している。現在までに多様なbat CoVの配列が報告されており、世界中のどの地域に分布するコウモリからもbat CoV RNAは検出されている。大変興味深いことに、日本のキクガシラコウモリからもSARS-CoV-2に比較的近縁なウイルス配列が報告されている(3)。ほとんどのbat CoVsはヒトや動物に病気を引き起こさないが、高い病原性を発揮する新型コロナウイルスが繰り返しコウモリから出現していることは注目に値する。次々と出現する新型コロナウイルスに対応するためには、単にヒトの感染症として研究を進めるアプローチだけでは不十分であろう。ワンヘルスのアプローチに基づき、コウモリにおけるCoVの生態を理解し、コウモリ-CoVの共生関係を明らかにして同ウイルスの制御法を探ることが重要である。こうした意味で、本学会のレターで話題を紹介したい。

  「新型コロナウイルスの出現経緯」、および「コウモリの病原体宿主としての特徴」に関しては「臨床と微生物(Vol.47, No.6)」でより詳細に概説している。そちらを参照されたい。

参考文献
1. Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, Si HR, Zhu Y, Li B, Huang CL, Chen HD, Chen J, Luo Y, Guo H, Jiang RD, Liu MQ, Chen Y, Shen XR, Wang X, Zheng XS, Zhao K, Chen QJ, Deng F, Liu LL, Yan B, Zhan FX, Wang YY, Xiao GF, Shi ZL. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020 Mar; 579 (7798): 270-273.
2. Zhou P, Fan H, Lan T, Yang XL, Shi WF, Zhang W, Zhu Y, Zhang YW, Xie QM, Mani S, Zheng XS, Li B, Li JM, Guo H, Pei GQ, An XP, Chen JW, Zhou L, Mai KJ, Wu ZX, Li D, Anderson DE, Zhang LB, Li SY, Mi ZQ, He TT, Cong F, Guo PJ, Huang R, Luo Y, Liu XL, Chen J, Huang Y, Sun Q, Zhang XL, Wang YY, Xing SZ, Chen YS, Sun Y, Li J, Daszak P, Wang LF, Shi ZL, Tong YG, Ma JY. Fatal swine acute diarrhoea syndrome caused by an HKU2-related coronavirus of bat origin. Nature. 2018 Apr; 556 (7700): 255-258.
3. Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M, Matsugo H, Kamiki H, Ishida H, Takenaka-Uema A, Shimojima M, Horimoto T. Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan. Emerg Infect Dis. 2020 Dec; 26 (12): 3025-3029.